شما هم اکنون در صفحه اختصاصی چگونه یک مطالعه صحیح بیوانفورماتیکی داشته باشیم قرار دارید.
برای ورود به منوی کاربری به منظور هدف مند کردن مطالعات بیوانفورماتیکی **مطالعه هدفمند بیوانفورماتیکی برای زیست شناسها** اینجا را کلیک کنید
پروژه bio-use و اهداف آن:
این صفحه بخشی از پروژه BIO-USE میباشد که توسط بابک باباعباسی شروع به کار کرده است.هدف از این پروژه تحقیق بر روی ارائه یک روش صحیح مطالعه و استفاده از نرم افزارها و بانکهای اطلاعاتی بیوانفورماتیکی است تا کاربران در سیل نرم افزارها و بانکهای اطلاعاتی دچار سر در گمی نشوند.
هدف از این پروژه برسی و کشف تمامی جنبه های تجربه انسانی و تعامل وی با ابزارها ،با تمرکز بر سادگی به کارگیری و نیازهای تحقیقاتی بیولوژیست ها جهت بهبود کارایی میباشد.به دلیل وابستگی تام ابزارهای انسان محور ،به رفتارهای انسانی ، هر فرد درگیر در طراحی ابزارهای بیوانفورماتیک باید ابتدا به تحلیل و درک تجربه شخصی بیولوژیست بپردازد تا قادر به مدل سازی رفتار او باشد .بالا رفتن قابلیت استفاده از این وبگاهها ،به طور مستقیم باعث پایین آمدن زمان و هزینه های آموزش ،آسان شدن انتقال از سیستمهای موجود به نسخه های جدید از سیستم های قدیم ،بالا رفتن کارایی و سودمندی نیروی انسانی ،اطمینان بیشتر از کیفیت کار و کمینه شدن احتمال خطاهای کاربر در حین ورود و استفاده از اطلاعات را در بر خواهد داشت.
- چند تا از پرس و جوهای معمول بیوانفورماتیک که ممکن است در پایگاه دادههای بیوانفورماتیکی مطرح شود در چهار دسته زیر قرار میگیرد.
- 1: پیدا کردن توالیهای شبیه به یک توالی خاص در پایگاه داده ،با داشتن تمام یا بخشی از توالی
- 2: پیدا کردن ساختارهای پروتئینی مشابه با یک ساختار پروتئینی دیگر در پایگاه داده ،با داشتن تمام یا بخشی از آن ساختار
- 3: پیدا کردن ساختارهایی که ساختارهای سه بعدی مشابه را میپذیرند .با در دست داشتن یک توالی پروتئینی نا شناخته.شاید در این مورد راه میانبری به نظر برسد که مثلا به دنبال پروتئینی با توالی مشابه بگردیم ولی این راه حل همیشه درست جواب نمیدهد و هنوز دانشمندان به دنبال جستجوهای قدرتمند تری میگردند.
- 4: یافتن توالی های مربوط به ساختارهای مشابه با در دست داشتن ساختار پروتئینی به دست آمده.داشتن متد و روشی که بتواند از روی یک توالی خاص ساختارش را بیرون بیاورد بسیار مورد نیاز و کارگشا خواهد بود
باید توجه کنیم هر بانک داده بدون روشهای کارآمد و سودمند دسترسی ،تبدیل به گورستانی از داده خواهد بود .
به طور حتم اگر محقق دقیقا بداند چه چیزی را میخواهد به دست بیاورد بخش زیادی از مسئله حل شده است!!
وقتی کاربر به یک بانک اطلاعاتی میرسد یقینا سوالات زیر را از خود میپرسد:
- آیا این بانک داده اطلاعات مورد نیاز را دارد؟
- چطور میتوان اطلاعات به دست آمده از بانک داده را به شکلی سودمند در کنار هم قرار داد؟
- در کدام بانک کدام اطلاعات زخیره شده است؟
با توجه به توضیحات بالا در این پروژه (bio-use) اهداف زیر را دنبال میکنیم:
ارائه یک منوی کاربری به منظور هدف مند کردن مطالعات بیوانفورماتیکی به نام **مطالعه هدفمند بیوانفورماتیکی برای زیست شناسها** که برای ورد اینجا را کلیک کنید
سوالات و مشکلات خود را در **انجمن های اینترنتی پرتال بیوانفورماتیک ** مطرح کنید .
سوالات معمول و شیوه همکاری و ویرایش این دانشنامه را در صفحه راهنما بخوانید.
این پروژه به صورت متن باز(open source) اجرا شد تا دیگر علاقه مندان به این موضوع بتوانند به راحتی در این پروژه عضو شوند و به ارائه مطلب و یا ویرایش مطلب بپردازند .این پروژه با مجوز GFDL در دسترس می باشد . یعنی استفاده و تغییر محتویات این کتاب و نوشته ها بر اساس این قانون آزاد می باشد .
- مسئول و راه انداز پروژه بابک باباعباسی babakbabaabasi@gmail.com
| 
